Vedoucí laboratoře: MUDr. Marta Kostrouchová, CSc.
Členové laboratoře: MUDr. Zdeněk Kostrouch, CSc., Lucie Zadinová, František Behenský, Hana Prouzová
Doktorandi a diplomanti: Ing. Johana Nákielná, MUDr. David Kostrouch, Bc. Petr Yilma, Veronika Kostrouchová, Nathaniel Kouns, Daniel Ramatebele, Tomáš Krekule, Paris Charilaou, Azzat Al-Redouan, Kateřina Šebková, Markéta Kostrouchová, Vladimír Zima, Ahmed Chughtai, Phillipp Jan Novotný, Kristýna Boušová.
Základní výzkumné zaměření:
Modelové systémy
Laboratoř je zaměřena na spojení komplexního biologického pojetí modelových organismů bezobratlých (především z rodiny Rhabditidae) s projekty lidské biologie a medicíny. Laboratoř řeší vlastní projekty z oblasti regulace genové exprese jadernými receptory a jejich kofaktory ve vztahu k metabolismu a vývoji metazoidních organismů. Laboratoř spolupracuje s dalšími experimentálními a klinickými pracovišti v řešení biomedicínkých otázek zapojením modelových systémů bezobratlých.
Laboratoř studuje regulační cesty jaderných receptorů, které jsou homologní steroidním, thyroidním a retinoidním receptorům s cílem odhalit zachovalé a diversifikované mechanismy, které tvoří biologickou podstatu těchto regulačních cest. Zvláštní důraz je kladen na spojení regulačních signálů z metabolismu do regulace vývoje jadernými receptory a jejich kofaktory.
Následným cílem práce laboratoře je experimentálně studovat funkci takových proteinů, které jsou důležité v lidské biologii a patologii. Tyto znalosti jsou důležité k pochopení diagnostických a terapeutických možností.
Molekulární patologie
Laboratoř je zaměřena na studium regulace integrace buněk v mnohobuněčném organismu. Laboratoř studuje proteiny, které jsou důležité v biologii nádorů a obnovy tkání. Cílem práce je pochopit mechanismus jejich funkce a eventuálně nalézt takové interakce, které by bylo možné ovlivnit malými molekulami.
Laboratoř používá komplexní bioinformatiku a experimentální metody molekulární biologie modelových systémů, především genetiky a genomiky C. elegans (ve spolupráci s Laboratoří modelových systémů), dalších bezobratlých modelových organismů, tkáňových kultur a klinického materiálu. Laboratoř využívá velkokapacitní analytické metody mapující exprimom a proteom. Laboratoř se soustředí na integrativní bioinformatické zpracování získaných dat a přispívání k tvorbě integrované biologie a patologie (Systems patology).
(Kostrouchova et al., Proc Natl Acad Sci U S A 2001, 98: 7360-7365; Kostrouchova et al., Proc Natl Acad Sci U S A 2002, 99: 9254-9259; Kostrouchova et al., Proc Natl Acad Sci U S A 2003, 100: 5240-5245; Brozova et al., Mech Dev 2006, 123: 689-701; Pohludka et al. BBRC, 2008, 374:49-54; Vohanka et al. Gene Expression Patterns 2010, (Kostrouchova et al., Proc Natl Acad Sci U S A 2001, 98: 7360-7365; Kostrouchova et al., Proc Natl Acad Sci U S A 2002, 99: 9254-9259; Kostrouchova et al., Proc Natl Acad Sci U S A 2003, 100: 5240-5245; Brozova et al., Mech Dev 2006, 123: 689-701; Pohludka et al. BBRC, 2008, 374:49-54; Vohanka et al. Gene Expression Patterns 2010, 10: 227-36; Carosa et al. J. Sex. Med 2010, 7:1381-90.)
