Součástí Ústavu dědičných metabolických poruch jsou tyto výzkumné laboratoře:
- Laboratoř genomiky a bioinformatiky
- Skupina genomiky a bioinformatiky dědičných poruch metabolismu
- Skupina poruch purinového metabolismu
- Skupina histopatologie dědičných poruch metabolismu a vzácných onemocnění
- Laboratoř biologie a patologie oka
- Laboratoř biochemie a buněčné biologie dědičných poruch metabolismu
- Laboratoř biochemické genetiky
- Skupina poruch metabolismu sirných aminokyselin
- Skupina poruch metabolismu kyseliny močové
